用 GPU 對抗新型冠狀病毒?NVIDIA 呼籲加入 Folding@home 運算

| 朱力恒 | 14-03-2020 18:15 | |

NVIDIA 呼籲大家用顯示卡進行《Folding@home》分布式運算計劃,協助分析 2019 新型冠狀病毒 (SARS-CoV-2) 的蛋白酶 (protease) 結構,藉此協助加快研究對抗藥物,及分析 SARS-CoV-2 是如何與人體 ACE2 (Angiotensin-converting enzyme 2;血管收縮素轉化酶 2) 受體之間結合。《Folding@home》官方近期已優先將所有分布式運算資源,優先用於上述對抗 SARS-CoV-2 相關的運算工作。

  • 利用 GPU 進行分布式運算
  • 《Folding@home》近期優先集中 SARS-CoV-2
  • 自發參與及付出,沒有利潤回報

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怎用 GPU (顯示核心) 去對抗 SAR2-CoV-2?其實《Folding@home》並非新事物,過去一直藉着分布式運算 (distributed computing),借助集合全球用家的 GPU《OpenCL》之硬體運算能力, 仿如變成一台虛擬超級電腦,去運算癌細胞的蛋白酶結構,或分析來自外太空的電波數據等。

只要是支援《OpenCL 1.1》或以上規格的 GPU,即基本上最近 7 至 8 年內推出的 GPU 如:NVIDIA GeForce GTX 400 系列及以上、AMD Radeon HD 4000 系列 (及以上)、Intel HD Graphics (Ivy Bridge 及以上) 等,均適用於執行《Folding@home》運算。

NVIDIA 呼籲全球用家、電競玩家,加入《Folding@home》運算,讓 GPU 變得有用!

今次 NVIDIA 官方純粹藉着 Twitter 而作出呼籲,真正發起人是《folding@home》高層 Dr. Greg Bowman。除了「N 卡」,當然「A 卡」用家亦可自發參與。《folding@home》已新設立以下 9 個針對 SAR2-CoV-2 相關的運算計劃,包括:

  • 14530/14531:Coronavirus SARS-CoV-2 (COVID-19 causing virus) protease - potential drug target;
  • 14328:Coronavirus SARS-CoV-2 (COVID-19 causing virus) protease - potential drug target;
  • 11741:Coronavirus SARS-CoV-2 (COVID-19 causing virus) receptor binding domain in complex with human receptor ACE2;
  • 11746:Coronavirus SARS-CoV-2 (COVID-19 causing virus) receptor binding domain in complex with human receptor ACE2 (alternative structure to 11741);
  • 11742:Coronavirus SARS-CoV-2 (COVID-19 causing virus) protease in complex with an inhibitor;
  • 11743:Coronavirus SARS-CoV-2 (COVID-19 causing virus) protease – potential drug target;
  • 11744:Coronavirus SARS-CoV (SARS causing virus) receptor binding domain trapped by a SARS-CoV S230 antibody;
  • 11745:Coronavirus SARS-CoV (SARS causing virus) receptor binding domain mutated to the SARS-CoV-2 (COVID-19 causing virus) trapped by a SARS-CoV S230 antibody。

《Folding@home》軟件設有 HTTP 圖像化操作介面,會自動辨認適用的 GPU,及自動分派運算計劃予用家,用家按下「Start Folding」便會開始運算。其實《Folding@home》這類分布式運算計劃,與近年一度熾熱的加密貨幣「挖礦」(Cryptocurrency Mining),技術上根本是同一回事,惟差異在於「挖礦」能賺取「酬勞」,加密貨幣理論上能兌換真實貨幣。但《Folding@home》是沒有任何回報,純粹靠用家無私付出,用家需承擔硬件與電費開支。

若用家擁有不錯的顯示卡,甚至是使用 NVIDIA SLI、AMD CrossFireX 多顯示卡方案,也不介意「蝕電費」,GPU 運算導致產生熱力,但願意為對抗 SARS-CoV-2 出一分綿力,應當積極考慮參與《Folding@home》運算。

兩、三年前全球「挖礦」熾熱,「礦機」正適合用來進行《Folding@home》運算。

《Folding@home》操作介面簡單,毋須複雜設定。

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Source:ezone.hk、NVIDIA (Twitter)、《Folding@home》
 

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